I microrganismi hanno una distribuzione ubiquitaria in natura e spesso organismi come l'uomo o gli animali vengono a contatto con essi.  Delle decine di migliaia di microrganismi fanno parte alcuni batteri che vivono nell'ambiente materiale inanimato in condizione di saprofitismo; in genere, la maggior parte di essi, non sono in grado di superare le barriere difensive dell'ospite e di adattarsi alla vita parassitaria. Una piccola parte può però superare le barriere dell'organismo ospite, adattar